給与計算ソフト比較おすすめ22選

人気の給与計算ソフトおすすめ5製品を一覧表にまとめました。自社の課題と照らし合わせながら全体像を掴んでみてください。

※ミツモア調べ（2025年12月時点）

※料金はプランや従業員数によって変動します。最新の情報は各公式サイトをご確認ください。

給与計算ソフトとは、従業員の給与計算に関わる一連の業務を自動化するためのシステムです。毎月の勤怠情報に基づいた総支給額の算出から、所得税や住民税、社会保険料といった複雑な控除額の計算、そして最終的な差引支給額の確定までを自動で行います。

製品によって対応できる給与体系や手当、残業代の計算方法、他システムとの連携方法が異なります。自社の給与規定や業務フローに合ったソフトを選ぶことで、手作業での調整や修正を減らし、担当者の負担を軽減できます。

また、法改正や保険料率の変更への対応も重要なポイントです。自動でアップデートされるソフトを選べば、設定変更の手間や対応漏れのリスクを抑えられます。

給与計算ソフト導入検討で多い業界は？

2025年9月〜11月にかけてミツモアにおいて、給与計算ソフトへの問い合わせが多かったのは下記の業界です。

• サービス：19.1％
• 建築・工事：17.9％
• 医療・福祉：14.9％
• 小売・卸売：10.8％

これらの業界は、時給や日給といった多様な雇用形態の従業員が多く、複雑な給与体系への対応が求められる共通点があります。 現在のソフトでは自社の給与体系に対応しきれない、という課題から乗り換えを検討するケースが多いと考えられます。

ミツモアなら、業種や欲しい機能などの各項目を画面上で選択するだけで、ぴったりの給与計算ソフトを最短1分で自動診断。もちろん費用はかかりません。

希望条件に沿った最大5製品の特徴や機能、料金プランを表示します。最適な製品の中から比較表で比較できるので、数多くの製品から絞り込む手間や時間もかかりません。ぜひ、給与計算ソフト選びにご活用ください。

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自社の給与体系に対応できるか

給与計算ソフトは製品ごとに対応できる給与体系や計算ルールが異なります。「対応可能」と記載されていても、自社の運用に合わないケースは少なくありません。特に確認しておきたいのは以下のポイントです。

■計算ルールへの対応

• 時間帯や曜日によって時給が変わる計算に対応できるか
• 固定残業代など自社独自の手当を設定できるか
• 複数の雇用形態（正社員、パート、契約社員など）を一つのソフトで管理できるか

■業務フローへの対応

• 複数の支社や店舗がある場合、本社で一括管理できるか、拠点ごとに処理できるか
• 拠点ごとに管理者IDを発行できるか、権限設定は柔軟か
• 承認フローは自社の組織体制に合わせて設定できるか

確認方法としては、無料トライアルやデモの際に、実際の給与データや組織構成に近い条件でテストするのが確実です。「○○の計算に対応できますか」「○○のような運用は可能ですか」と具体的にベンダーへ質問し、対応可否だけでなく設定方法まで確認しておくと、導入後のギャップを防げます。

既存の他システムとの連携方法を確認する

勤怠管理システムや会計ソフトとの連携は、給与計算ソフトを選ぶ上で重要なポイントです。ただし「連携可能」と記載されていても、連携方法によって実際の手間は大きく異なります。

自社で使っているシステムとAPI連携できるのか、CSV連携のみなのか。API連携の場合はどこまで自動化されるのか、CSV連携の場合はフォーマット加工が必要か。具体的な連携方法と作業の流れをベンダーに確認しておくと安心です。

乗り換えや導入時のサポート体制はどうか

給与計算ソフトの乗り換えでは、データ移行や初期設定など、導入時に手間がかかる作業が発生します。この負担をどこまでベンダーがサポートしてくれるかは、製品によって大きく異なります。

■データ移行のサポート

• 従業員情報や過去の給与データの移行を自社で行うのか、ベンダーが代行してくれるのか
• 移行作業にかかる期間はどのくらいか

■導入時のサポート

• 初期設定のサポートはあるか
• 操作説明や研修は受けられるか

■導入後のサポート

• 問い合わせ方法は電話、メール、チャットなど希望する方法に対応しているか
• サポートの対応時間はいつか（給与計算の締め日に対応してもらえるか）

給与計算アウトソーシングという選択も考えてみる

給与計算ソフトの乗り換えや、現在の運用方法の見直しを検討する際、もう一つの選択肢として「給与計算アウトソーシング（代行）」があります。給与計算ソフトを導入または乗り換えるではなく、給与計算業務そのものを外部の専門家に委託する方法です。

単にソフトが使いにくいだけでなく、担当者の負担が大きい、専門知識に不安があるといった課題を根本から解決したい場合に有効な選択肢です。

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給与計算ソフトの導入を成功させるためには、ソフト選定後にもいくつかの重要なポイントがあります。スムーズな移行と運用のために、以下の点に注意しましょう。

初期設定とデータ移行を計画的に進める

導入時には、従業員情報や給与規定の設定、過去データの移行が発生します。特に、勤怠管理や会計ソフトとの連携を予定している場合は、事前に連携テストを行い、想定通りにデータが反映されるか確認しておきましょう。移行作業の期間も見積もり、給与計算のスケジュールに影響が出ないよう計画することが大切です。

従業員への丁寧な説明とフォローを行う

給与明細の確認方法や申請フローが変わる場合、従業員への事前の周知が不可欠です。特に、ITツールに不慣れな従業員がいる場合は、操作方法の説明会を開くなど丁寧なフォローが求められます。従業員の理解と協力を得ることが、スムーズな運用につながります。

担当者が不在でも対応できる体制を整える

給与計算は、締め日から支払日までの期間が短く、毎月正確さが求められる業務です。特定の担当者しか操作できない状態では、急な休みや退職時に業務が滞るリスクがあります。操作手順をまとめたマニュアルを作成し、複数名が対応できる体制を整えておきましょう。

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給与計算ソフトは製品によって特徴や機能もさまざま。「どの製品を選べばいいかわからない・・・」といった方も多いのではないでしょうか。

そんなときはミツモアにおまかせ。最短1分の自動診断で、ぴったりの勤怠管理システムが見つかります。

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ぴったりの料金プランも一緒にお届け

希望条件に沿った料金プランも製品と一緒に診断します。概算金額を見積もりからチェックして、理想のプランを探してみましょう。

診断結果は最大5製品！比較・検討で最適な給与計算ソフトが見つかる

最大で5製品の診断結果をお届けします。検討していた製品だけでなく、思わぬ製品との出会いもあるかもしれません。

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